Bei der Moskauer Opernsängerin Natalia Kostenko erhielt er eine intensive Gesangsausbildung zum hohen Bariton. An der Hochschule für Kirchenmusik in Bayreuth legte Stefan Wasser das kirchenmusikalische B-Examen ab, worauf ihn unter anderem Prof. Hans Joachim Bartsch (Christuskirche Mainz) vorbereitete. Es folgten weitere private Studien in Orgel und Orgelimprovisation bei Prof. Thorsten Laux (Robert Schumann Institut Düsseldorf) und sehr intensive langjährige Dirigierstudien beim argentinischen Kapellmeister Julio Malaval und bei Fred Buttkewitz (Hochschule für Musik Hanns Eisler, Berlin). Stefan Wasser betreute verschiedene Musikensembles, wie z. B. den Chor des Fachbereichs Theologie in Mainz und den Blechbläserkreis Saulheim und gründete 1992 in Zusammenarbeit mit der Musikschule des Donnersbergkreises den „Nordpfälzer Oratorienchor“, mit dem er jährlich mehrere Oratorien, Opern und Sinfoniekonzerte (u. a. Zauberflöte, Martha, Schöpfung, Carmina Burana) aufführte. Seit 2008 leitet er ebenfalls die Konzertgesellschaft Bad Kreuznach. Stefan Wasser komponierte vier Opern für Kinder, die er in Zusammenarbeit mit professionellen Orchestern an verschiedenen Theatern und Schulen aufführte. Nach dem 2. Staatsexamen am Burggymnasium Kaiserslautern ist er als Musik- und Religionslehrer tätig und unterrichtet seit 2003 am Gymnasium am Römerkastell Bad Kreuznach.